东王府的密室非常隐秘，只有杨秀清、陈承瑢两人知道。当初，土营数十人负责建筑这个密室。事成之后，杨秀清将那些土营将士全部处死，防止泄密。
正当杨秀清在密室中惴惴不安时，密室的门被打开了。许宗扬脸上露出狰狞的笑容，冲杨秀清喝道：“杨秀清，你也有今天，出来受死吧！”
杨秀清这才知道，是陈承瑢出卖了他。他坦然走出密室，看到门外的太平军将士，突然仆地，又要使出“天父下凡”的鬼把戏。
“天父下凡”有一个前提：杨秀清周围必须遍布亲信、侍卫，这样才能威慑其他人。如今，杨秀清孤身陷入敌军，谁还信他的鬼把戏？
许宗扬一剑刺中杨秀清的肩膀，骂道：“东贼，你死到临头，还要装神弄鬼！”
杨秀清被带到了韦昌辉面前。
这个一向在杨秀清面前卑躬屈膝、低声下气的韦昌辉，这个最被杨秀清看不起的韦昌辉，在杨秀清最想不到的时候，杀杨秀清一个措手不及。又以迅雷不及掩耳之势，杀得东殿毫无招架之力。
杨秀清忍住巨痛，对韦昌辉说道：“我要见天王，只有天王能够杀我。”
韦昌辉手提长剑，狞笑道：“我奉天王密诏，特来诛杀你这个乱臣贼子！”
说罢，韦昌辉瞄准杨秀清心脏，一剑刺了进去。
按照洪秀全的设想，诛杨行动只杀杨秀清、杨元清、杨润清、杨转清四人，不得株连太广。
但从9月3日凌晨起，韦昌辉的北殿、秦日纲的燕殿部队就杀红了眼。东王府、参护府内，尸横满地。东王府内文武官吏、男女老幼，参护府内的刀牌手们，死难的有数千人。
天亮后，洪秀全发布诏令，诛贬杨秀清为“东孽”，对外宣布他“窃据神器，妄称万岁，已遭天殛”。
按，这个诏书出自洪秀全本人，被传统史学界认作是杨秀清逼封万岁的关键证据。其实，传统史学界受历史价值观影响，难免要尊洪贬杨。洪秀全说杨秀清“妄称万岁”，多半是为了撇清自己在天京事变中的责任。
同理，石达开兵败被俘后，其口供有三个版本：《三略汇编》、《骆文忠公奏议》和《蜀燹述略》，《三略汇编》相对更加详细可信。据《三略汇编》，石达开口供中称“洪秀全本欲杀杨，口中不肯，且故意加杨秀清为万岁”。
这便是“洪秀全加封万岁说”的来源。但石达开远在湖北，显然不可能详知天京事变的内幕。石达开这样说，要么是撇清自己在天京事变中的责任，要么就是根据洪秀全的说辞。
可见，杨秀清谋反、逼封万岁之说并不成立。天京事变的导火索，正是陈承瑢诬告杨秀清谋反，其根源还在于太平天国的神权、政权冲突。
洪秀全下达诏书，声称既往不咎，只株首恶，进一步麻痹了残存的东殿党羽。他们逐渐停止抵抗，放下了武器。
实际上，杨秀清刻薄寡恩，部下离心离德。史载，天京事变第二天，东王府附近的军民纷纷闯入王府，抢夺府内的珠宝财物，根本没人关心东王是死是活。
同样的，残余的东殿刀牌手抵抗亦不激烈。除了韦昌辉兵马强大外，洪秀全的诏书亦有力地瓦解了他们的抵抗意志。
韦昌辉阴狠毒辣，对放下武器的东王府文武官吏、东殿刀牌手，全都杀杀杀，不留一个活口。
这时候，官兵都杀红了眼，早就把洪秀全“不得滥杀无辜”的禁令忘得一干二净。
